水质自动在线监测系统属于无人值守连续工作，因此对检测仪器的结构、性能、检测灵敏度及运行稳定性都有相当高的要求，为保证能长期可靠的连续运行和准确获取监测数据，必须加强水质自动在线监测系统的质量保证工作，用科学的管理办法和严格的质量保证措施使水质自动监测站为环境管理服务。仪器在运行过程中的质量保证基本如下：

1、室温一般是保证在20℃左右；

2、系统各部分的安全完好情况；

3、系统的运行状态和主要技术参数，判断运行是否正常；

4、检查控制系统、通讯系统、监测采样、分析系统是否正常，清洗管路和采样杯内的沉积物；

5、定期更换试剂及清洗液，定期对电极进行维护；

6、传感器和电极随着使用时间的延长，会发生漂移，定期对传感器和电极进行标定；

7、定期更换电极和蠕动泵管；保证仪器使用的纯水、试剂、标准溶液达到质量保证要求；

8、仪器运行中发现故障及时处理，无法排除的故障及时与系统集成商，同时对仪器设备的维修做好相关记录。